引自10x Genomics的亚细胞空间原位表达分析技术（Xenium），通过已有/定制探针panel与靶点，在新鲜冷冻（FF）组织或福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织切片上快速检测大量靶点的组织原位转录本表达水平，实现亚细胞分辨率对基因进行靶向空间原位分析，揭示细胞结构与功能的关系。

 一、技术流程及原理

首先在Xenium载玻片上制备FF或FFPE组织切片（每块载玻片上的可成像区域为12mm x24mm）。然后对切片进行处理，RNA能更好的与可环化的DNA探针进行杂交。杂交探针连接后产生可酶促扩增的环状DNA探针。之后将载玻片放入Xenium分析仪中，样本在其中经过连续几轮的荧光探针杂交、成像和去除，产生明亮、易于成像且高信噪比的信号。接着生成每个基因特异性的荧光特征条码，实现目标基因的定位和识别。最后构建出整张组织切片上亚细胞水平的空间原位图谱。

 二、技术特点与优势

1、亚细胞分辨率

原位显微成像的检测方法，保留RNA分子的原位特征，亚细胞分辨率水平还原组织中细胞最真实的大小和边界区分，实现“真”细胞-细胞通讯、受体-配体互作的可视化研究。

2、兼容多样本类型

兼容新鲜冷冻组织（FF）和福尔马林固定石蜡包埋组织（FFPE）样品，满足临床及科研样本的检测分析需求。

3、高灵敏性和特异性

平均每个基因设计8对探针，根据表达量高低调整探针数量；独特的配对捕获探针设计，增强了检测的灵敏性和特异性。

4、panel组合灵活定制

panel基础上，可灵活定制多至100个靶标基因，更兼容全定制服务，增强了临床和科学研究的创新性，同时可根据普通转录组RNA-seq以及单细胞转录组数据scRNA-seq实验中已获取的数据，定制高达300个靶点的个性化研究策略，助力转化研究和空间水平挖掘。

5、全景“无gap”扫描及玻片再利用

成像区域（12 x 24 mm）内开展超高重靶点的组织全景无gap扫描，Xenium实验后仍可继续利用同一玻片做其他实验，可高效充分地利用珍贵的临床样本。

6、强大的数据综合分析及深度挖掘能力

完全标准化的集成生物信息学分析流程，经验丰富的多组学数据分析团队，能够对生物学数据及临床数据进行综合分析及深度挖掘，使得数据挖掘更加便捷化、个性化。

 三、技术服务内容

目前官方已经推出panel包括：人乳腺 280 个基因、人脑 266 个基因、人肺 289 个基因、人皮肤282个基因、人结肠322个基因、人肿瘤免疫380个基因、人类多种组织癌症组织377个基因、小鼠脑 247 个基因和小鼠组织图谱379个基因，以上panel均可增加 1~100 定制化基因。应用场景仍在不断拓展，未来会有更多组织类型的商品化 Panel，应用于肿瘤、发育等不同领域的探索。

 四、服务流程