WB实验中最抓马的问题当属无条带:WB实验内参条带非常漂亮,整齐干净,但是目的条带就是做不出来。
但并不是每一次无条带都是抗体的问题,样本、实验方法都可能导致失败。
怎么找出无条带的原因?以下五个自查,帮你找到问题的根源!
第一式——查抗体
第二式——查样本
第三式——查说明书
第四式——方法互证
第五式——实验操作自查

第一式——查抗体
一抗种属、应用、sensitivity有没有问题?
二抗有没有用错?二抗的应用看一抗种属来源。
注意:如果是厂家未验证过的种属和应用,不推荐使用。
第二式——查样本
确定所用的细胞/组织中表达您的靶标蛋白么?表达丰度如何?
①查阅相关文献;
②查阅以下数据库:
http://www.biogps.org:通过mRNA表达水平给您参考估计不同样本中目的蛋白的表达水平
http://www.uniprot.org:了解目的蛋白可变剪切体、蛋白表达位置、可修饰类型等
http://www.phosphositeplus.org:蛋白质翻译后修饰权威数据库,查阅修饰类蛋白的表达条件和丰度、刺激方式等
第三式——查说明书
产品说明书中都有写明抗体的稀释比例,但这不是一层不变的,需要根据情况适当增加抗体比例。说明书中都列举出相应的配套试剂,这些都是厂家经过实验反复验证后的吐血推荐,保证你你能得到最佳信噪比的结果。
第四式——方法互证
IHC、IF实验在做染色之前,可用WB实验验证样本中是否有表达。
第五式——实验操作自查
样本提取过程:
是否加入蛋白酶或/和磷酸酶抑制剂?是否在冰上操作?
PMSF是单一的丝氨酸酶抑制剂,建议加入protease inhibitor /phosphatase inhibitor cocktail;
是否进行超声?
超声处理能更好的破坏胞膜和核膜释放核蛋白同时打断染色质DNA,最大程度的从细胞中提取靶标蛋白,保证平行样本间裂解的一致性。
蛋白浓度:
根据蛋白定量的结果适当增加上样量至50-80ug;
转膜过程:
转膜效率如何?
采用丽春红染料进行转膜效率的验证;
封闭方法转换?
尝试使用另一种封闭方法;
优化洗涤条件:
洗涤时间勿过久,3次,每次5-10min即可;
抗体孵育过程:
严格筛选的一抗;
稀释比和稀释液的选择:请参照抗体说明书,如未标注,可采用5%脱脂牛奶/TBST或5%BSA/TBST进行稀释;
显影过程:
灵敏度合适的底物;
显色底物避免过度消耗;
显色底物避免放置过久而失活;
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